122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0498 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  85.61 
 
 		 139 aa  253  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  70.8 
 
 		 142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  69.78 
 
 		 140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  67.39 
 
 		 139 aa  207  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  67.39 
 
 		 139 aa  207  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  61.87 
 
 		 139 aa  193  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  32.82 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  50.77 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  44.44 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  33.6 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  41.1 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  30.69 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  37.31 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  38.81 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  42.86 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  38.81 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  38.96 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  28.95 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  40.26 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  31.3 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 149 aa  52.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  36 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  28.45 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  34.29 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  32.86 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  33.78 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  33.78 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  41.1 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  42.25 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  26.77 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  26.15 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  28.57 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  31.34 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  36.11 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  25.29 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  23.77 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  23.81 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  35.62 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  32.8 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  27.93 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  36.36 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  28.57 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  25.42 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  36.11 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  30.3 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  24.32 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  21.9 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  34.15 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  30.51 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  31.08 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  29.87 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  24.11 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  27.56 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  33.78 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  26.21 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  23.33 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  23.33 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  26.89 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>