73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0384 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  100 
 
 		 138 aa  288  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  46.72 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  41.18 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  39.71 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  40.15 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1648  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645842  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  39.57 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  36.13 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  32.23 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  30.17 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  30.17 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  32.48 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  32.48 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  32.48 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  32.48 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  31.62 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  31.78 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  32.48 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  29.91 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  31.62 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  33.33 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  32.46 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  29.25 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  42.86 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  30.12 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  28.21 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  26.5 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  29 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  33.33 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  25.66 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  44.44 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  25 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  32.1 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  35 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  26.53 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  31.76 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  27.38 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  25.77 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  25.22 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  27.87 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  26.76 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  56.41 
 
 		 109 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 140 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  25.83 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  21.55 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  24.22 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1354  transcriptional repressor, CopY family  34.34 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  30.56 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  39.44 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 133 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>