53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2616 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 133 aa  270  7e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  26.98 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  32.2 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3732  CopY family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  28 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  26.23 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  28.78 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  29.17 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  28.69 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  28.15 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  32.48 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  27.41 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  24.79 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  29.29 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  29.13 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  28.21 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  26.09 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  27.73 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  26.09 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  28.46 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  28.46 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  29.57 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  26.27 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  27.64 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  27.64 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  27.64 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  28.69 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  30.7 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  21.74 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  24.24 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  26.13 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  20.34 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  27.1 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  26.83 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  22.13 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5182  transcriptional repressor, CopY family  25 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717917  hitchhiker  0.0058899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2142  CopY family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.325229 
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  24.36 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  25.93 
 
 		 138 aa  40  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  27.93 
 
 		 128 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>