47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5182 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5182  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 132 aa  270  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717917  hitchhiker  0.0058899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  71.55 
 
 		 121 aa  174  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2754  transcriptional repressor, CopY family  60.83 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  51.28 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  49.15 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  44.35 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  46.09 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  40.83 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  27.93 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  25.22 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  30.1 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  25.22 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  32.29 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  23.48 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  25 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  31.09 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  27.27 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  26.32 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  27.12 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0677  penicillinase repressor  29.17 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  23.21 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  23.48 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  20.51 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  24.37 
 
 		 124 aa  43.9  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  28.74 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  24.37 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  23.93 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 124 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2142  CopY family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.325229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  25.47 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  23.39 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  25 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  23.21 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>