136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0075 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  288  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  82.58 
 
 		 146 aa  231  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  81.06 
 
 		 146 aa  226  8e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  38.05 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  31.9 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  26.36 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  33.98 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  31.67 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  31.62 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  30.4 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  28.46 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  25.83 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  26.09 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  25 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  30.91 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  32.48 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  22.61 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  29.36 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  30.51 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  38.03 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  31.62 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5182  transcriptional repressor, CopY family  25.22 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717917  hitchhiker  0.0058899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  30 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  28.74 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  27.68 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  23.97 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  34.67 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  23.48 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  28.44 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  25.22 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  28.44 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  29.91 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  36 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  36 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  22.22 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  33.33 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  33.33 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  23.66 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  25.83 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2754  transcriptional repressor, CopY family  21.67 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  27.52 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  33.33 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  28.57 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  26.4 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  24.8 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  33.78 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  27.12 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  22.41 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  24.79 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  25.69 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  31.3 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  24.71 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  29.27 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  20.91 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  23.77 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  25 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  30.43 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  32 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  30.43 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  30.43 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  30.43 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  20.87 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>