118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2616 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 124 aa  247  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  52.17 
 
 		 169 aa  136  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 123 aa  117  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  42.86 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 125 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  43.33 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  42.98 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  42.15 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  42.98 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  42.98 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  42.15 
 
 		 132 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  42.98 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  39.13 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  42.24 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  42.24 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  42.48 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  41.18 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  37.61 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  38.46 
 
 		 161 aa  97.1  8e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  38.1 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  37.61 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  36.13 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  31.93 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  31.9 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  31.45 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  31.93 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  31.93 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  31.03 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  27.27 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  29.41 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1648  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  30.25 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  29.06 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  23.73 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  26.89 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  28.45 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  28.33 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  27.05 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2324  CopY family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  24.37 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1589  transcriptional regulator  26.5 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  19.44 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  26.23 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  26.23 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1354  transcriptional repressor, CopY family  38 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  22.22 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  27.87 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  25.44 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  23.89 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3470  transcriptional repressor, CopY family  26.27 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3145  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2098  transcriptional repressor, CopY family  25.41 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560575  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  30.49 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  26.19 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  22.95 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  28.18 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  28.57 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  23 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0677  penicillinase repressor  22.94 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  23.58 
 
 		 205 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0730  transcriptional repressor, CopY family  24.58 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  21.19 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  23.02 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  26.89 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  22.22 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0165  transcriptional repressor, CopY family  24.56 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.272376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2354  CopY family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000228636  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0076  transcriptional repressor, CopY family  22.12 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726818  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  25.42 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  20.87 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  30.1 
 
 		 126 aa  47.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  30.1 
 
 		 126 aa  47.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  24.32 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  19.17 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  24.56 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  27.73 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  24.62 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  19.3 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2142  CopY family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.325229 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>