147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1285 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  97.12 
 
 		 139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  77.37 
 
 		 139 aa  227  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  62.32 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  37.4 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  28.46 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  28.46 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  28.46 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  28.46 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  28.46 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  28.46 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  28.46 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  43 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  27.64 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  27.64 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  39.8 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  44.32 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  32.5 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  31.93 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  37.08 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  42.42 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  32.2 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  31.36 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2754  transcriptional repressor, CopY family  29.77 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  32.77 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  29.91 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  42.03 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  35.19 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  43.24 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  32.48 
 
 		 118 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  38.1 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  28.81 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  39.13 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  30.51 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  39.13 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  28.74 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  28.81 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  33.63 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  36.47 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  32.14 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  29.25 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  38.24 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  25.22 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  31.15 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  33.03 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  37.21 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  38.27 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  24.35 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  38.24 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  25.22 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  23.48 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  40.54 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  29.46 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  29.73 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  28.45 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  26.42 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  27.97 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1351  transcriptional repressor, CopY family protein  23.58 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.204472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  30.49 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  30.63 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 133 aa  50.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  34.88 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  28.7 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  26.72 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  29.2 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>