109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11874 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  273  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  85.07 
 
 		 138 aa  197  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  85.07 
 
 		 138 aa  197  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  85.07 
 
 		 138 aa  197  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  85.71 
 
 		 138 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  84.96 
 
 		 138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  80.51 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  69.92 
 
 		 132 aa  176  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  59.17 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  57.72 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  55.12 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  58.16 
 
 		 131 aa  110  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  50.38 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 185 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  49.57 
 
 		 118 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  52.54 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  49.64 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  49.14 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  51.79 
 
 		 116 aa  89.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  54.31 
 
 		 182 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  46.72 
 
 		 131 aa  88.6  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  47.93 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  43.1 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  47.71 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  42.24 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  36 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  43.48 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  40.16 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  40 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  40 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  40 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  45.54 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  39.84 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  40.17 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  46.15 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  42.61 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  37.07 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  39.66 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  39.66 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  36.84 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  40.71 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  32.2 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  37.08 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  37.19 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  31.19 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  32.77 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  31.46 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  43.37 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  29.31 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  34.15 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  33.93 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  35.96 
 
 		 114 aa  50.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  29.84 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  29.51 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  31.62 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  28.91 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  32.94 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  34.12 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  34.12 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  27.97 
 
 		 205 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  32 
 
 		 137 aa  43.9  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  32 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  32 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  32 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  32 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  32 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  26.09 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  32.52 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  30.67 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1669  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.92 
 
 		 321 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>