124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1643 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 131 aa  259  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  55.93 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  55.81 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  61.06 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  57.52 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  59.29 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 185 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  58.77 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  54.1 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  57.02 
 
 		 159 aa  103  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  54.81 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  56.19 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  52.21 
 
 		 118 aa  97.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  53.45 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  50.88 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  44.74 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  45.61 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  47.11 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  46.96 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  45.69 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 182 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  49.52 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  48.44 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  44.07 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 153 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  44.8 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  45.54 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  46.49 
 
 		 125 aa  83.6  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  43.1 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  43.59 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  43.59 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  38.6 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  38.26 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  40.52 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  44.35 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  29.13 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  29.13 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  34.23 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  36.28 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  36.36 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  37.11 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  34.51 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  34.75 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  35.63 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  39.39 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  34.67 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  36 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  29.66 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  34.12 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  34.07 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5280  CopY family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219064  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  37.8 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  33.77 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  29.73 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  41.38 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2840  CopY family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.941683  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  29.73 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  29.33 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  30 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  35.56 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  34.82 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  28.38 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  28.38 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  28.38 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  28.38 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>