63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2233 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 133 aa  256  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7010  CopY family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 142 aa  98.6  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  49.57 
 
 		 114 aa  97.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  47.5 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  44.35 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5280  CopY family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219064  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  42.86 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  41.9 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  37.31 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  36.44 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  37.86 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  34.26 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  32.26 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  32 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  32 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  37.04 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  41.41 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  37.5 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  35.11 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  38.68 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  36.79 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  30.7 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  35.2 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  31.09 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  37.76 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  36.13 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  37.5 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  39.68 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  43.94 
 
 		 133 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  31.25 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  37 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  30.4 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 141 aa  40.8  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  32.88 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  34.69 
 
 		 132 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>