70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7010 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7010  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  280  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  47.46 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  46.73 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  44.74 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  44.26 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5280  CopY family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219064  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  40.34 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  38.05 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  34.71 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  32.77 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  29.77 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  30.83 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  42.11 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  33.05 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  36.89 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  34.48 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  38.39 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  38.37 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  32.48 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  32.48 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  32.76 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  34.86 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  34.51 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  37.61 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  35.71 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  36.89 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  32.52 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  34.4 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  34.71 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  42.65 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  30.58 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  40.32 
 
 		 131 aa  43.9  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  34.57 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  28.97 
 
 		 139 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  28.97 
 
 		 139 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  28.95 
 
 		 142 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  41.94 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>