52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4290 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 132 aa  252  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5280  CopY family transcriptional regulator  57.02 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219064  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  48.7 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  42.74 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  48.54 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  46.07 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  40.37 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7010  CopY family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  41.12 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  33.62 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  35.66 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  30.4 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  30.36 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  37.61 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  37.5 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  35.65 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  35.4 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  36.71 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  31.19 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  31.19 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  40 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  29.2 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  35.8 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  34.65 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  29.09 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  33.93 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  34.21 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  30 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 121 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  26.32 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  34.51 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  39.76 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>