133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37280 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 127 aa  250  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  62.93 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  61.4 
 
 		 154 aa  140  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  59.84 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  62.39 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  62.07 
 
 		 133 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  55.86 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  59.22 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  53.91 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  55.12 
 
 		 138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  54.78 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  56.14 
 
 		 129 aa  104  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  58.25 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  52.29 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  48.21 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  45.08 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  40.17 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 182 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  50.43 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  46.85 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  45.38 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  44.64 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  49.09 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  43.75 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  51.06 
 
 		 122 aa  87.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  44.04 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  44.04 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  45.08 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  50 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 124 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  46.43 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  43.75 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  39.47 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  42.31 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  32.74 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  37.27 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  41.03 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  41.59 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  45.45 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  44.74 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  36.29 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  39.74 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  45.83 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  43.94 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  37.23 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  38.55 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  45.68 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  30.08 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5280  CopY family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219064  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  30.08 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  40.96 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  26.09 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  31.07 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  36.71 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  23.53 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  28 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  36.11 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  36.11 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  29.27 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  41.89 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  38.38 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  36.11 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2840  CopY family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.941683  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  27.66 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  28.69 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  26.6 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  26.6 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>