123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4311 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 141 aa  278  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  39.39 
 
 		 139 aa  97.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 140 aa  94.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  50 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  40 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  40 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  44.9 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  42.74 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  39.66 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  40.52 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  29.71 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  28.99 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  28.99 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  28.99 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  28.99 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  28.99 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  28.99 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  34.71 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  41.59 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  28.26 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  28.26 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  38.89 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  36.97 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  36.94 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  34.82 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  36.97 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  39.64 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  41.75 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  37.72 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  34.23 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  28.8 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  36.84 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  26.62 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  34.55 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  26.62 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  33.61 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  37.14 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  36.17 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  32 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  29.2 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  34.4 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  35.78 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  34.75 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  30.65 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  28.1 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  36.25 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  35.83 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  36.52 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  29.59 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2483  transcriptional repressor, CopY family  44.09 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.481913  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  68.75 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  36.47 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  36.47 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  25.88 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  31.93 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  24.71 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  36.9 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  24.71 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1351  transcriptional repressor, CopY family protein  30.53 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.204472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  23.46 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  26.67 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  34.33 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  35.9 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>