86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2483 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2483  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 
132 aa  258  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.481913  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  44.09 
 
 
141 aa  77  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  36.28 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  33.63 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  38.39 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  29.73 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  48 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  39.47 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  44.23 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  41.18 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  41.59 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  28.83 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  28.83 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  27.93 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  27.93 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  27.93 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  27.93 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  27.93 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  42.06 
 
 
129 aa  60.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  35.24 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  27.93 
 
 
137 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  28.69 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  40 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  40.2 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  44.34 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  43.97 
 
 
154 aa  58.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  40.57 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  39.29 
 
 
148 aa  58.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  41.18 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  41.18 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  41.18 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  35.78 
 
 
123 aa  57.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  37.25 
 
 
166 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  44.95 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  42.31 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  37.25 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  43.48 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  44.23 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  35.34 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  41.23 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  36.46 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  36.27 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  40 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  35.34 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  43.27 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  29.2 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  34.26 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  34.86 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  36.27 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  36.27 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  34.48 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  29.2 
 
 
139 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  45.07 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  45.07 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  37.86 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  47.62 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  34.21 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  46.58 
 
 
185 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  33.33 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  33.33 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  32.58 
 
 
130 aa  50.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  42 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  29.06 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  29.06 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  39.76 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  36.79 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  39.6 
 
 
118 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  40.3 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  34.65 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  34.43 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  42.47 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  31.25 
 
 
149 aa  43.5  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  35.45 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  26.05 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  25.42 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  27.27 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  34.11 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  29.41 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  34.12 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  27.72 
 
 
139 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  29.09 
 
 
121 aa  40.8  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  37.33 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  26.8 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  33.72 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  36.19 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  39.74 
 
 
126 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>