95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0305 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 129 aa  246  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  59.65 
 
 		 185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  52.59 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  53.39 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  57.63 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 182 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  50 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  50 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  52.14 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  50.42 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  50.88 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  51.75 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  46.61 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  50.91 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  47.93 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  48.31 
 
 		 129 aa  86.7  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  45.83 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  51.43 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  43.36 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  40.87 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  43.36 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  43.7 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  49.14 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  39.47 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  38.79 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  39.83 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  38.6 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  37.5 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  38.14 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  37.39 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  34.51 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  39.09 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  31.17 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  31.17 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  31.17 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  31.17 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  31.17 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  31.17 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  31.17 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  35.65 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5280  CopY family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219064  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  39.47 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  38.75 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  29.11 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  34.12 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  26.05 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  35.8 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  35.14 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  32.77 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  32.71 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  35.14 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  37.18 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  28.85 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  32.48 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  30.77 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  32.05 
 
 		 125 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  29.52 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  34.85 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  34.85 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  27.18 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  32.5 
 
 		 205 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>