72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2556 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 109 aa  210  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  47.52 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  47.92 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5280  CopY family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 149 aa  76.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219064  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  42.72 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  48.54 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7010  CopY family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  45.78 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  40.78 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  42.11 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  42.11 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  38.74 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  45.54 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  39.09 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  44.9 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  41.18 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  40.26 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  36.45 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  36.28 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  39.74 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  37.23 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  35.35 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  40.24 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  40.79 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  38.64 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  36.47 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  29.81 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  32.04 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  40 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  36.05 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  43.9 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  36.05 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  34.69 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  32.88 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  34.33 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  32.53 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  40 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  46.94 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  56.41 
 
 		 138 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  33 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1351  transcriptional repressor, CopY family protein  32.94 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.204472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  28.16 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 124 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 129 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>