66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3609 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 121 aa  233  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  53.6 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  54.03 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  53.21 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  48.67 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  48.21 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 185 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  48.21 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  47.62 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  45.13 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  42.86 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  46.15 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  46.43 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  45.9 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  43.36 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  43.36 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  48.08 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  49.14 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  44.83 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  40.71 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  44.74 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  38.74 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  45.54 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  36 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  44.14 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  40.57 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 138 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  35.54 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  37.96 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  35.96 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  38.98 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  44.9 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  35.14 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  41.44 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  30 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  30 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  30 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  35.71 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  39.13 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  35.71 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  34.51 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  38.89 
 
 		 258 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>