136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3352 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 128 aa  256  8e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  47.93 
 
 		 133 aa  124  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  43.33 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  46.09 
 
 		 133 aa  117  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  46.09 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  45.22 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  45.22 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  45.22 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  42.86 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  43.09 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  39.82 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  41.88 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  41.88 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  41.74 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  40.71 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  39.47 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  34.19 
 
 		 161 aa  85.5  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  35 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  38.6 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  33.9 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  39.47 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  31.58 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  38.74 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  32.79 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  32.23 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0730  transcriptional repressor, CopY family  31.67 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  25.2 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  26.96 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  30.7 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  28.33 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  30 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  24.17 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  31.58 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  33.05 
 
 		 124 aa  67  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  24.78 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2098  transcriptional repressor, CopY family  27.97 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560575  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2324  CopY family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3145  transcriptional regulator  26.72 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  30.43 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  28.93 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  29.41 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  26.72 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  30.17 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  26.27 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  28.1 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  28.57 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1589  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  30.61 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  25.41 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1354  transcriptional repressor, CopY family  34.62 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  26.45 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2354  CopY family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000228636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3470  transcriptional repressor, CopY family  25.83 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  27.87 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  22.31 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  28.69 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0165  transcriptional repressor, CopY family  23.53 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.272376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  23.28 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  23.73 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  27.87 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1648  transcriptional regulator  29.47 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645842  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  21.24 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  24.79 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  24.17 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  27.68 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  25.86 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  33.77 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  28 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  25.26 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  20.34 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  27.45 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  24.14 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  22.76 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>