67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0049 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  290  4e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1648  transcriptional regulator  40.88 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645842  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  38.97 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  39.55 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  31.88 
 
 		 161 aa  99.4  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  31.43 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  32.09 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  31.34 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  34.48 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  30.77 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  30.17 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  30.17 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  29.91 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  30.77 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  29.91 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  30.77 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  24.78 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  26.06 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  27.83 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  27.35 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  28.45 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  27.5 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  26.02 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  31.07 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  29 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  24.35 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  25.89 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  24.35 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  19.47 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  19.47 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  19.47 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  26.67 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  23.97 
 
 		 121 aa  47.4  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  20 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  21.43 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  23.93 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  25.25 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  21.49 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  18.1 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1589  transcriptional regulator  23.08 
 
 		 120 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  26.42 
 
 		 126 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  28.95 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  28 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  21.74 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  23.47 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  22.12 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  24.35 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  23.01 
 
 		 122 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  23.21 
 
 		 124 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  25.66 
 
 		 127 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>