86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1459 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  100 
 
 		 126 aa  244  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  95.24 
 
 		 126 aa  229  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  95.24 
 
 		 126 aa  229  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  95.73 
 
 		 117 aa  213  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  61.98 
 
 		 123 aa  137  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  61.98 
 
 		 123 aa  137  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  61.98 
 
 		 123 aa  137  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  34.43 
 
 		 169 aa  87  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 124 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  38.6 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  34.96 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  29.17 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  40 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  34.15 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  34.15 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  34.15 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  29.82 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  34.48 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  33.33 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  31.93 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  26.72 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  25.86 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  21.19 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  30.12 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  28.07 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  30.51 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  23.48 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1354  transcriptional repressor, CopY family  45.74 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  28.81 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  30.43 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  23.97 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  23.01 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  19.47 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  21.55 
 
 		 128 aa  48.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  22.81 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  23.53 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0730  transcriptional repressor, CopY family  22.03 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  23.36 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  23.81 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  23.53 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  18.1 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  23.66 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  19.51 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2098  transcriptional repressor, CopY family  21.01 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560575  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  23.42 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3470  transcriptional repressor, CopY family  23.48 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  23.16 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  30.36 
 
 		 118 aa  44.3  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  17.21 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  18.42 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  22.88 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  18.42 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  20.54 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  21.43 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  16.81 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 120 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  21.74 
 
 		 123 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  21.24 
 
 		 148 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1648  transcriptional regulator  26 
 
 		 147 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  25 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  20.72 
 
 		 149 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  22.94 
 
 		 126 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  25.66 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  23.53 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  26.67 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  25.93 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  21.7 
 
 		 205 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3145  transcriptional regulator  19.33 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>