77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0948 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  295  2e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  40.85 
 
 		 161 aa  126  9.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  45.45 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  40.71 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  40.15 
 
 		 138 aa  120  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  38.73 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  39.71 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1648  transcriptional regulator  39.42 
 
 		 147 aa  110  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645842  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  36.09 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  31.93 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  32.76 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  35 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  36.52 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  36.75 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  36.75 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  36.75 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  36.75 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  36.75 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  30.58 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  30.58 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  34.19 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  32.74 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  33.04 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  31.86 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  28.95 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  30.7 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  30.36 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  22.4 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  23.73 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  30.77 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  23.73 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  26.45 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  24.35 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  29.36 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  21.82 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  28 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  24.37 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  22.73 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  20.54 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  26.17 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  24.19 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  25.22 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  26.67 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  22.12 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  25 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  24.11 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  26.23 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  29.91 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  22.12 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  31.25 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  19.59 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2354  CopY family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000228636  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  19.59 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  22.81 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  27.93 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  30.68 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  21.01 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  20.49 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  30.67 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>