106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_1078 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  100 
 
 		 132 aa  268  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  100 
 
 		 132 aa  268  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  97.73 
 
 		 132 aa  263  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  96.97 
 
 		 133 aa  260  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  96.21 
 
 		 133 aa  259  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  89.15 
 
 		 133 aa  236  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  45.22 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  44.7 
 
 		 169 aa  113  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  47.9 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 131 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  41.6 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  42.98 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  38.21 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  43.1 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  37.9 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  37.9 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 122 aa  93.2  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  37.93 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  32.8 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  34.15 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  34.96 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  35.09 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  29.91 
 
 		 161 aa  72  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  33.63 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  32.2 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  32.48 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  30 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  29.75 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  27.73 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  28.21 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  33.61 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  27.78 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  29.51 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  30.65 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  27.73 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  35.85 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0730  transcriptional repressor, CopY family  27.27 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  27.2 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1354  transcriptional repressor, CopY family  38.68 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  26.5 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  30.71 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  31.36 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  31.4 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  26.09 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3145  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  27.05 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  25.62 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2098  transcriptional repressor, CopY family  24.79 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  30.51 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  26.5 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3470  transcriptional repressor, CopY family  23.33 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2142  CopY family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.325229 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1648  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645842  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  28.24 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  23.14 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2324  CopY family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2354  CopY family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000228636  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  23.73 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  25.19 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1589  transcriptional regulator  23.33 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  36.36 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  23.48 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0677  penicillinase repressor  31.45 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  27.64 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  30.97 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  30.97 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  30.97 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  30.97 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0317  CopY family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  hitchhiker  0.0079489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  25.21 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  21.55 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  22.41 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>