82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1873 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  320  6e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  38.97 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  38 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  35.38 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1648  transcriptional regulator  42.64 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645842  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  34.62 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  33.33 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  33.33 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  34.03 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  32.46 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  31.03 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  31.03 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  30.43 
 
 		 128 aa  77  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  33.33 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  33.33 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  33.33 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  33.33 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  33.33 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  31.97 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  25.42 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  28.93 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  29.75 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  30.58 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  35.23 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  27.27 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  28.33 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  26.89 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  28.91 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  28.33 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  29.31 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  27.59 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  24.17 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  23.28 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  25.21 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  25.45 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  24.76 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  25.23 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  29.75 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  31.58 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1354  transcriptional repressor, CopY family  31.78 
 
 		 126 aa  48.5  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  23.2 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  20 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  23.58 
 
 		 124 aa  44.3  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  25.47 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  23.77 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  20.34 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  26.09 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  24.49 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  22.31 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  19.13 
 
 		 140 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  22.31 
 
 		 139 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  23.85 
 
 		 155 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  22.69 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  29.41 
 
 		 121 aa  41.6  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0677  penicillinase repressor  19.67 
 
 		 133 aa  40.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>