93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4382 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  100 
 
 
126 aa  256  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  47.06 
 
 
124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  47.06 
 
 
130 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  47.5 
 
 
121 aa  120  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  46.61 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  42.5 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5182  transcriptional repressor, CopY family  40.83 
 
 
132 aa  100  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717917  hitchhiker  0.0058899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  38.84 
 
 
121 aa  100  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2754  transcriptional repressor, CopY family  35.59 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  30.09 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  32.76 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  31.9 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  29.2 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  30.69 
 
 
126 aa  60.1  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  35 
 
 
138 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  33.75 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  28.45 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  30.09 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  32.5 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  32.5 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  32.5 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  25.26 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  30.97 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  24.21 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0677  penicillinase repressor  28.21 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  23.66 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  25.45 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2142  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.325229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  31.03 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  26.55 
 
 
118 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  30.39 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  30.39 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  25.22 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  27 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  30.43 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  27.93 
 
 
139 aa  47.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  20 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  28 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  20 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  31 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  20 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  25.64 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  25.64 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  28 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  30.12 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  29.33 
 
 
131 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  28 
 
 
139 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  28 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  27.17 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  26.25 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  31.33 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  27.17 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  32.22 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  19.51 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  23.33 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  29.13 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  29.2 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  29.13 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  27.17 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  26.26 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  22.94 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  31.71 
 
 
185 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  25.22 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  26.09 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  25.32 
 
 
141 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  26 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  26.5 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  22.32 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  23.08 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  19.51 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  19.51 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  22.94 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  31.25 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  26.09 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  22.55 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  28.7 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  22.88 
 
 
122 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  23.93 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  22.02 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  23.93 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  21.85 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  24.19 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  19.13 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  23.93 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  27.38 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  22.61 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  31.03 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  20.43 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  25.47 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  26.92 
 
 
122 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>