96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07470 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  100 
 
 		 117 aa  240  3.9999999999999997e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  64.96 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  59.66 
 
 		 119 aa  153  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  47.32 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  45.61 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  50 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  47.32 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 120 aa  113  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  51.33 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  42.37 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  42.37 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  41.38 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  40.71 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  38.14 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  32.2 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  35.24 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  35.19 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  31.9 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  29.36 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  31.48 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  31.3 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  26.61 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  26.61 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  30.83 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  26.67 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  26.67 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  30.43 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  25.83 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  25.83 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  25.83 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  29.79 
 
 		 139 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  27.5 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  24.17 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  28.07 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  25.44 
 
 		 130 aa  50.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  30 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  31.11 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  25.93 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  31.11 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  25.64 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  24.14 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  27.68 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 166 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  26.72 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  25.41 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  26.96 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  26.79 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  25.49 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  28.93 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  24.58 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1354  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  23.73 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  33.33 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  24.47 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  24.47 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  24.17 
 
 		 123 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  24.17 
 
 		 123 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 123 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 129 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  21.01 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  26.5 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  21.1 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  24.07 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2754  transcriptional repressor, CopY family  23.68 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  26.67 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  29.36 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  25 
 
 		 124 aa  40.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  28.33 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 122 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  31.37 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  26.13 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  27.93 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>