55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0076 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0076  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 128 aa  254  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726818  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  29.66 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  28.45 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  26.83 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  26.09 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  29.06 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  29.66 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  32.46 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  26.96 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  28.33 
 
 		 205 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  25.64 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2324  CopY family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  32.43 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0730  transcriptional repressor, CopY family  28.32 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  27.43 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  22.12 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  27.05 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0165  transcriptional repressor, CopY family  27.73 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.272376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  25 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  30.68 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  27.59 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  27.48 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  27.2 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  27.35 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  26.72 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  26.55 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  32 
 
 		 121 aa  42  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  32 
 
 		 121 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 139 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  32 
 
 		 121 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  33.68 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  25 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  19.17 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  19.17 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  19.17 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  30.48 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  37.5 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  22.5 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>