73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1829 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  100 
 
 
178 aa  359  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  43.35 
 
 
183 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  38.69 
 
 
189 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2690  hypothetical protein  35.43 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2636  hypothetical protein  35.43 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2178  hypothetical protein  37.71 
 
 
187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1475  YuaC  36.21 
 
 
180 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.472023  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  37.98 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  31.01 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  35.16 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
192 aa  67.4  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  42.03 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  26.24 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  28.24 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  28.24 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  38.1 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  26.11 
 
 
194 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 
181 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  30.23 
 
 
194 aa  55.1  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  30 
 
 
214 aa  55.1  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  32.61 
 
 
175 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  26.44 
 
 
166 aa  54.3  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  28.74 
 
 
192 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  23.6 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  31.88 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  32.35 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  35.29 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  31.88 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  31.88 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  25.2 
 
 
186 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  25.93 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  27.38 
 
 
198 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  26.73 
 
 
191 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  24.63 
 
 
192 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  26.43 
 
 
175 aa  52  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  25.37 
 
 
177 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  24.39 
 
 
218 aa  51.2  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 
190 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  25 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  24.63 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  24.63 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  24.63 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  24.63 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  24.63 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0868  hypothetical protein  23.75 
 
 
192 aa  48.9  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  25.21 
 
 
213 aa  48.9  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  32.89 
 
 
155 aa  48.5  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  24.28 
 
 
191 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  23.13 
 
 
192 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  35.94 
 
 
181 aa  48.5  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  28.57 
 
 
183 aa  48.1  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  32.89 
 
 
163 aa  48.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  30.77 
 
 
187 aa  47.8  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  28.05 
 
 
193 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  28.36 
 
 
179 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  32.35 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  28.57 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  28.8 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
193 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  40.38 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  23.62 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  30.88 
 
 
207 aa  45.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
145 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  26.09 
 
 
187 aa  45.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  25.32 
 
 
185 aa  44.7  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  29.11 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  32.39 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  25 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0691  transcriptional regulator, TrmB  30.09 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>