68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1298 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  100 
 
 
192 aa  380  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  25.47 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  34.09 
 
 
171 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  39.51 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  32.97 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  34.29 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0868  hypothetical protein  34.83 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  34.18 
 
 
167 aa  62.8  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  32.91 
 
 
168 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  29.17 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  32.86 
 
 
194 aa  62  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 
192 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 
181 aa  61.6  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  32.53 
 
 
175 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  37.1 
 
 
178 aa  61.6  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  32.05 
 
 
186 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  32.05 
 
 
186 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  34.29 
 
 
213 aa  61.2  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  31.68 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 
191 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  32.86 
 
 
214 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  38.6 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  27.91 
 
 
187 aa  58.9  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  30.26 
 
 
190 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  23.78 
 
 
207 aa  57.8  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  36.84 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  32.91 
 
 
166 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  38.71 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  25.66 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  33.33 
 
 
183 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  27.63 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  27.63 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  27.63 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  39.06 
 
 
181 aa  55.5  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  38.71 
 
 
186 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  38.71 
 
 
186 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  26 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  31.43 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
185 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  28 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  25.62 
 
 
177 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  25.62 
 
 
177 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1475  YuaC  30.34 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.472023  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  26.32 
 
 
191 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  25.62 
 
 
177 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  25.62 
 
 
177 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  25.62 
 
 
177 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  25.62 
 
 
177 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  29.11 
 
 
175 aa  51.2  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  30.34 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  22.08 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  22.52 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  23.74 
 
 
155 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
145 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  20 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  25 
 
 
218 aa  48.5  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2178  hypothetical protein  27.5 
 
 
187 aa  47.8  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2636  hypothetical protein  24.71 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2690  hypothetical protein  24.71 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  27.66 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1438  transcriptional regulator, TrmB  26.42 
 
 
125 aa  41.6  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>