74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2885 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  358  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  54.71 
 
 		 186 aa  194  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  53.8 
 
 		 186 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  54.71 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 185 aa  190  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  49.71 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  49.71 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  50.29 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  49.14 
 
 		 177 aa  174  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  49.14 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  49.14 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  49.14 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  47.13 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  47.09 
 
 		 194 aa  168  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  47.13 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  45.35 
 
 		 194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  44.77 
 
 		 214 aa  158  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  47.67 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  46.51 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  44.77 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  43.02 
 
 		 186 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  43.02 
 
 		 186 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  43.02 
 
 		 186 aa  154  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  44.25 
 
 		 207 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  42.44 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  45.93 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  44.19 
 
 		 192 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  42.53 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  46.15 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  44.19 
 
 		 192 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  43.79 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  41.86 
 
 		 190 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  41.77 
 
 		 174 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  34.3 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  37.65 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  34.68 
 
 		 181 aa  121  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  40.25 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  35.71 
 
 		 187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  31.65 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  32.76 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  34.72 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  33.59 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  33.59 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  32.81 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  31.25 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  25.34 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  32.71 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  28.48 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  31.94 
 
 		 171 aa  51.6  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  28.19 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  26.35 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  26.55 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  22.08 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  25.17 
 
 		 175 aa  48.5  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2178  hypothetical protein  22.33 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  23.62 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  26.09 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2636  hypothetical protein  21.71 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2690  hypothetical protein  21.71 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  30.89 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  28 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  30.89 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  30.89 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0868  hypothetical protein  22.6 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  29.6 
 
 		 150 aa  44.3  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  22.11 
 
 		 189 aa  44.3  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  31.43 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  28.46 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  26.81 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  20.97 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  23.78 
 
 		 154 aa  42  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>