77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4777 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  78.92 
 
 		 186 aa  304  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  78.92 
 
 		 186 aa  303  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  78.38 
 
 		 186 aa  301  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  67.58 
 
 		 189 aa  260  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  52.94 
 
 		 174 aa  190  9e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  49.11 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  45.71 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  45.25 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  45.71 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  45.25 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  45.25 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  45.25 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  46.96 
 
 		 218 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  47.4 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  42.7 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  44.57 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  41.76 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  43.35 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  45.34 
 
 		 174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  42.77 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  43.35 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  41.52 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  41.62 
 
 		 214 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  41.71 
 
 		 191 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  41.62 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  40.94 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  41.03 
 
 		 178 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  42.17 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  35.67 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  46.2 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  36.97 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  34.48 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  33.53 
 
 		 181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 193 aa  118  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  36.42 
 
 		 168 aa  117  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  36.25 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  37.58 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 193 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  39.71 
 
 		 193 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  38.97 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  36.76 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  24.66 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  34.53 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  24.49 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  30.93 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  37.04 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  25.16 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  31.93 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  31.63 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  31.93 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  31.93 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2636  hypothetical protein  22.75 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2690  hypothetical protein  22.75 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  38.71 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2178  hypothetical protein  24.64 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  25.61 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  35.87 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0868  hypothetical protein  27.2 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  32.23 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  46.3 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  28.47 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2135  hypothetical protein  32.39 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.421336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  29.71 
 
 		 152 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1475  YuaC  26.09 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.472023  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0691  transcriptional regulator, TrmB  39.62 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  30.93 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  33.65 
 
 		 193 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>