70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0439 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  53.16 
 
 		 166 aa  181  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  45.88 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  36.42 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  36.36 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  36.08 
 
 		 194 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  36.36 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  35.8 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  36.42 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  36.99 
 
 		 178 aa  114  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  34.38 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  34.16 
 
 		 186 aa  111  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  34.38 
 
 		 186 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  37.41 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  36.3 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  43.2 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  34.59 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  33.33 
 
 		 191 aa  107  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  35.47 
 
 		 214 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 185 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  34.03 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  35.97 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  39.39 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  32.1 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  37.8 
 
 		 213 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  36.3 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  35.53 
 
 		 181 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  35.26 
 
 		 217 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  40.31 
 
 		 187 aa  99.4  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  35.11 
 
 		 187 aa  98.2  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  35.33 
 
 		 181 aa  97.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  35 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  35 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  35 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  35 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  35 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  34.29 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  32.37 
 
 		 207 aa  94.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 198 aa  94.4  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 193 aa  92.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  30.26 
 
 		 189 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  26.67 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  33.83 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  33.08 
 
 		 193 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  33.08 
 
 		 193 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  30.5 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  34.18 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2178  hypothetical protein  25.86 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  23.6 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2636  hypothetical protein  24.79 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2690  hypothetical protein  24.79 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  31.65 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  27.38 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  27.78 
 
 		 198 aa  51.2  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  24.39 
 
 		 189 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2135  hypothetical protein  24.83 
 
 		 147 aa  47.8  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.421336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  30 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  27.16 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1475  YuaC  26.47 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.472023  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  26.32 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  29.63 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  31.4 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 334 aa  40.8  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1182  transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 		 99 aa  40.8  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00795875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>