More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4426 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  100 
 
 
465 aa  951    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  99.78 
 
 
465 aa  949    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  99.78 
 
 
465 aa  949    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  100 
 
 
465 aa  951    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  100 
 
 
465 aa  951    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  100 
 
 
465 aa  951    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  99.78 
 
 
465 aa  949    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  66.01 
 
 
479 aa  616  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  66.01 
 
 
479 aa  616  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  66.01 
 
 
479 aa  616  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  65.38 
 
 
474 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  65.38 
 
 
474 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  67.33 
 
 
465 aa  613  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  65.38 
 
 
474 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  66.15 
 
 
453 aa  602  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  67.28 
 
 
437 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  67.28 
 
 
437 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  67.28 
 
 
437 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  67.28 
 
 
437 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  66.08 
 
 
480 aa  596  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  66.08 
 
 
480 aa  596  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  63.09 
 
 
466 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  68.12 
 
 
414 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  62.06 
 
 
466 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  62.06 
 
 
466 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  62.06 
 
 
466 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  62.06 
 
 
466 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  62.06 
 
 
466 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  62.06 
 
 
466 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  62.06 
 
 
466 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  62.06 
 
 
466 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  62.06 
 
 
466 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  62.06 
 
 
466 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  62.06 
 
 
466 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  62.06 
 
 
466 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  62.06 
 
 
466 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  62.47 
 
 
481 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  62.98 
 
 
402 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0476  IS30 family transposase  61.48 
 
 
300 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.15798 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  45.87 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  45.87 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  45.87 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  45.87 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  45.87 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  45.87 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  45.87 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  45.87 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  45.87 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  45.87 
 
 
457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  47.64 
 
 
519 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  47.64 
 
 
519 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  47.64 
 
 
496 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  47.64 
 
 
519 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  47.64 
 
 
525 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  47.64 
 
 
519 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  47.64 
 
 
519 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  45.07 
 
 
326 aa  301  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  45.33 
 
 
385 aa  298  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  45.33 
 
 
385 aa  297  4e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  43.65 
 
 
423 aa  291  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  43.65 
 
 
423 aa  291  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  43.65 
 
 
423 aa  291  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  43.65 
 
 
423 aa  291  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  43.65 
 
 
423 aa  291  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  45.41 
 
 
386 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  45.41 
 
 
386 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  40 
 
 
385 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  40 
 
 
385 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  44.56 
 
 
386 aa  286  7e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  44.03 
 
 
342 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  43.5 
 
 
386 aa  280  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  42.97 
 
 
386 aa  277  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  41.49 
 
 
385 aa  276  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  43.5 
 
 
386 aa  275  9e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  40.33 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  43.43 
 
 
386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  40.33 
 
 
380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  39.5 
 
 
408 aa  272  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  43.77 
 
 
386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  39.12 
 
 
386 aa  268  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  42.07 
 
 
421 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  43.72 
 
 
409 aa  264  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  41.22 
 
 
339 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  42.15 
 
 
342 aa  263  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  42.15 
 
 
342 aa  263  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  42.15 
 
 
342 aa  263  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  41.22 
 
 
339 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  41.22 
 
 
339 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  42.15 
 
 
342 aa  263  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  42.15 
 
 
342 aa  263  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  42.15 
 
 
342 aa  263  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  42.15 
 
 
342 aa  263  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  42.15 
 
 
342 aa  263  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  42.15 
 
 
342 aa  263  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0462  Integrase catalytic region  38.04 
 
 
400 aa  260  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  43.73 
 
 
370 aa  256  8e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  39.29 
 
 
401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  38.2 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  38.2 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  38.84 
 
 
401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.103123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>