More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1249 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1249  integrase, catalytic region  100 
 
 		 246 aa  510  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0925898  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 317 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  40.6 
 
 		 335 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  40.6 
 
 		 335 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  40.6 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  40.6 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  40.6 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  40.66 
 
 		 315 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04691  IS1112 transposase  36.18 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02992  IS1112 transposase  36.18 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04709  IS1112 transposase  36.18 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01527  IS1112 transposase  36.18 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01635  IS1112 transposase  36.18 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.085128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  36.18 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  40.2 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  39 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  39 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  39 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  40.2 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4403  integrase catalytic region  40.2 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.291607  normal  0.47214 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  36.18 
 
 		 322 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  36.18 
 
 		 322 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  36.18 
 
 		 322 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  36.18 
 
 		 322 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  36.18 
 
 		 322 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  38.59 
 
 		 315 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  35.77 
 
 		 322 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04853  IS1112 transposase  35.77 
 
 		 322 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0362678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02275  transposase  37.17 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 313 aa  125  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 313 aa  125  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03519  IS1112 transposase  34.96 
 
 		 322 aa  125  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00803  IS1112 transposase  35.77 
 
 		 322 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0987141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  36.02 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 313 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 313 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 313 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 313 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  36.44 
 
 		 313 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  34.89 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3746  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00109  transposase  35.84 
 
 		 324 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  34.04 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0783  integrase catalytic subunit  34.04 
 
 		 313 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03884  IS1112 transposase  34.55 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2359  integrase catalytic subunit  33.19 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.747939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03216  IS1112 transposase  34.96 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  36.78 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04791  IS1112 transposase  34.96 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.030193  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  36.78 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05593  IS1112 transposase  39.18 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119198  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 342 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 342 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 342 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  34.98 
 
 		 342 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  34.98 
 
 		 342 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  34.98 
 
 		 342 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  34.98 
 
 		 342 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  34.98 
 
 		 342 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  34.98 
 
 		 342 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  36.33 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03989  IS1112 transposase  33.33 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  34.84 
 
 		 342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00579  transposase  37.69 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  37.45 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  34.57 
 
 		 342 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  35.39 
 
 		 342 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  34.98 
 
 		 423 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  34.98 
 
 		 423 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  34.98 
 
 		 423 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  34.98 
 
 		 423 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  34.98 
 
 		 423 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00575  transposase  38.14 
 
 		 197 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  35.42 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  35.42 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  35.42 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  34.02 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  35.34 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1808  transposase  32.92 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0221  transposase  32.92 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0319  transposase  32.92 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>