More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3419 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  100 
 
 		 386 aa  800    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  78.24 
 
 		 386 aa  626  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  76.88 
 
 		 386 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  76.68 
 
 		 386 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  75.65 
 
 		 386 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  74.87 
 
 		 386 aa  578  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  74.87 
 
 		 386 aa  578  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  68.13 
 
 		 386 aa  539  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  75.73 
 
 		 342 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  55.7 
 
 		 386 aa  418  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  56.1 
 
 		 385 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  55.84 
 
 		 385 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  55.84 
 
 		 385 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  56.68 
 
 		 370 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  52.56 
 
 		 380 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  52.29 
 
 		 380 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  48.15 
 
 		 383 aa  351  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  47.88 
 
 		 383 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  47.88 
 
 		 383 aa  349  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  47.88 
 
 		 383 aa  349  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  47.88 
 
 		 383 aa  349  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  47.88 
 
 		 383 aa  349  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  47.88 
 
 		 383 aa  349  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03536  IS30 transposase  46.8 
 
 		 374 aa  315  6e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.727826  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03481  hypothetical protein  46.8 
 
 		 374 aa  315  6e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  50.46 
 
 		 354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  50 
 
 		 385 aa  306  6e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  49.69 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  50.93 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  51.46 
 
 		 409 aa  296  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  48.97 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  48.97 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  48.97 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  48.97 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  48.97 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  48.97 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  48.97 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  48.97 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  48.97 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  48.97 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 		 479 aa  278  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 		 479 aa  278  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 		 479 aa  278  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  43.58 
 
 		 480 aa  277  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  43.58 
 
 		 480 aa  277  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  49.23 
 
 		 496 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  49.23 
 
 		 519 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  49.23 
 
 		 519 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  49.23 
 
 		 519 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  49.23 
 
 		 519 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  49.23 
 
 		 525 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  49.23 
 
 		 519 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  44.44 
 
 		 402 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  47.87 
 
 		 423 aa  275  9e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  47.87 
 
 		 423 aa  275  9e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  47.87 
 
 		 423 aa  275  9e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  47.87 
 
 		 423 aa  275  9e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  47.87 
 
 		 423 aa  275  9e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3082  integrase catalytic subunit  60.99 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3408  putative transposase IS30  45.25 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  43.77 
 
 		 465 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  43.77 
 
 		 465 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  43.77 
 
 		 465 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  43.77 
 
 		 465 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  43.77 
 
 		 465 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  43.77 
 
 		 465 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  43.43 
 
 		 474 aa  272  9e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  43.43 
 
 		 474 aa  272  9e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  43.43 
 
 		 437 aa  272  9e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  43.43 
 
 		 437 aa  272  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  43.43 
 
 		 474 aa  272  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  43.43 
 
 		 437 aa  272  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  43.43 
 
 		 437 aa  272  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  43.43 
 
 		 414 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  43.5 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 466 aa  269  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 466 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 466 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 466 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 466 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 466 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 466 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 466 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 466 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 466 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 466 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 466 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 466 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  43.59 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  47.78 
 
 		 336 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  41.85 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  40.91 
 
 		 465 aa  264  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  46.77 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  44.72 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  46.79 
 
 		 342 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  46.79 
 
 		 342 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  46.79 
 
 		 342 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  46.79 
 
 		 342 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  46.79 
 
 		 342 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  46.79 
 
 		 342 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>