More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3082 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3082  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 253 aa  526  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  62.16 
 
 		 385 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  61.71 
 
 		 385 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  63.88 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  59.29 
 
 		 385 aa  295  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  64.57 
 
 		 342 aa  293  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  64.13 
 
 		 386 aa  290  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  59.73 
 
 		 380 aa  288  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 386 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  61.23 
 
 		 386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  59.29 
 
 		 380 aa  285  5e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  60.79 
 
 		 386 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  65.61 
 
 		 386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  61.43 
 
 		 386 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  61.43 
 
 		 386 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  60.99 
 
 		 386 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  63.02 
 
 		 370 aa  262  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  57.83 
 
 		 519 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  57.83 
 
 		 496 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  57.83 
 
 		 519 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  57.83 
 
 		 519 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  57.83 
 
 		 519 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  57.83 
 
 		 519 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  57.83 
 
 		 525 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  52.85 
 
 		 402 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  54.29 
 
 		 466 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  54.29 
 
 		 466 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  54.29 
 
 		 466 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  54.29 
 
 		 466 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  54.29 
 
 		 466 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  54.29 
 
 		 466 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  54.29 
 
 		 466 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  54.29 
 
 		 466 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  54.29 
 
 		 466 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  54.29 
 
 		 466 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  54.29 
 
 		 466 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  54.29 
 
 		 466 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  54.29 
 
 		 481 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  54.29 
 
 		 466 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  52.84 
 
 		 326 aa  250  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  50.41 
 
 		 479 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  50.41 
 
 		 479 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  50.41 
 
 		 479 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  51.71 
 
 		 414 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  51.71 
 
 		 474 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  51.71 
 
 		 474 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  51.71 
 
 		 437 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  51.71 
 
 		 437 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  51.71 
 
 		 474 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  51.71 
 
 		 437 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  51.71 
 
 		 437 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  50 
 
 		 480 aa  244  9e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  50 
 
 		 480 aa  244  9e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  49.19 
 
 		 453 aa  242  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  50.81 
 
 		 465 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  52.61 
 
 		 385 aa  242  3.9999999999999997e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  50.81 
 
 		 465 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  50.81 
 
 		 465 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  50.81 
 
 		 465 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  50.81 
 
 		 465 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  50.81 
 
 		 465 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  52.61 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  49.8 
 
 		 466 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  57.42 
 
 		 409 aa  240  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  50.41 
 
 		 465 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  49.39 
 
 		 465 aa  235  4e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  53.28 
 
 		 457 aa  234  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  53.28 
 
 		 457 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  53.28 
 
 		 457 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  53.28 
 
 		 457 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  53.28 
 
 		 457 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  53.28 
 
 		 457 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  53.28 
 
 		 457 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  53.28 
 
 		 457 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  53.28 
 
 		 457 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  51.11 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  53.28 
 
 		 457 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  51.11 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  50.66 
 
 		 339 aa  231  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  50.66 
 
 		 339 aa  231  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  50.66 
 
 		 339 aa  231  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  49.34 
 
 		 340 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  47.11 
 
 		 383 aa  224  8e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  49.14 
 
 		 343 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  50 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  46.67 
 
 		 354 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 383 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 383 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  46.67 
 
 		 383 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  46.67 
 
 		 383 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  46.67 
 
 		 383 aa  223  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  46.67 
 
 		 383 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  49.56 
 
 		 334 aa  222  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  49.56 
 
 		 334 aa  222  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  50.65 
 
 		 423 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  50.65 
 
 		 423 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  50.65 
 
 		 423 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  50.65 
 
 		 423 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  50.65 
 
 		 423 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  45.56 
 
 		 401 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>