More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3627 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3746  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  99.36 
 
 
313 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  99.68 
 
 
313 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0783  integrase catalytic subunit  99.68 
 
 
313 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2645  integrase catalytic subunit  100 
 
 
251 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  77.32 
 
 
313 aa  501  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  77.32 
 
 
313 aa  501  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  77.32 
 
 
313 aa  501  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  77.32 
 
 
313 aa  501  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  77 
 
 
313 aa  499  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  77 
 
 
313 aa  500  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  77 
 
 
313 aa  500  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  77 
 
 
313 aa  500  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4284  integrase catalytic subunit  71.92 
 
 
273 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  52.73 
 
 
315 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
315 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
315 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
315 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  52.41 
 
 
315 aa  325  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  43.53 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  43.53 
 
 
335 aa  239  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  43.53 
 
 
335 aa  238  9e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  43.53 
 
 
335 aa  238  9e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  43.53 
 
 
335 aa  236  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  44.4 
 
 
290 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4403  integrase catalytic region  44.4 
 
 
290 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.291607  normal  0.47214 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  44.4 
 
 
290 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03519  IS1112 transposase  39.1 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  38.71 
 
 
322 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04691  IS1112 transposase  38.71 
 
 
322 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01635  IS1112 transposase  38.71 
 
 
322 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.085128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01527  IS1112 transposase  38.71 
 
 
322 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04709  IS1112 transposase  38.71 
 
 
322 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02992  IS1112 transposase  38.71 
 
 
322 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03989  IS1112 transposase  38.71 
 
 
322 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04853  IS1112 transposase  38.71 
 
 
322 aa  208  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0362678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  38.46 
 
 
322 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  38.46 
 
 
322 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  38.46 
 
 
322 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  38.46 
 
 
322 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  38.46 
 
 
322 aa  208  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  38.46 
 
 
322 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  38.68 
 
 
317 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03884  IS1112 transposase  37.82 
 
 
322 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03216  IS1112 transposase  37.74 
 
 
322 aa  199  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04791  IS1112 transposase  37.74 
 
 
322 aa  199  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.030193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00803  IS1112 transposase  37.18 
 
 
322 aa  198  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0987141  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0519  transposase  38.96 
 
 
318 aa  188  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0454  transposase  38.96 
 
 
318 aa  188  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1082  transposase  38.96 
 
 
318 aa  188  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1723  transposase  38.96 
 
 
318 aa  188  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1637  transposase  38.96 
 
 
318 aa  188  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0259  transposase  38.96 
 
 
318 aa  188  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0164  transposase  38.96 
 
 
318 aa  188  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1466  transposase  38.96 
 
 
318 aa  188  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00579  transposase  39.64 
 
 
299 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00109  transposase  37.2 
 
 
324 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1090  transposase  38.51 
 
 
288 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02275  transposase  37.92 
 
 
289 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04491  transposase  41.26 
 
 
219 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01240  transposase  39.73 
 
 
249 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.839107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  36.28 
 
 
316 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  36 
 
 
408 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  35.91 
 
 
386 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  34.85 
 
 
385 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  34.85 
 
 
385 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  36.22 
 
 
386 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  33.85 
 
 
339 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  35.91 
 
 
342 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  36.11 
 
 
386 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  35.08 
 
 
386 aa  149  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  35.08 
 
 
386 aa  149  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  35.29 
 
 
386 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  35.29 
 
 
386 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_62  putative integrase  32.37 
 
 
321 aa  148  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559018  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  33.64 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  33.64 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  33.64 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  33.64 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  36.19 
 
 
386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  34.24 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>