More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02275 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02275  transposase  100 
 
 
289 aa  591  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00803  IS1112 transposase  97.77 
 
 
322 aa  501  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0987141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03884  IS1112 transposase  97.77 
 
 
322 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  96.65 
 
 
322 aa  490  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  96.65 
 
 
322 aa  490  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  96.65 
 
 
322 aa  490  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  96.65 
 
 
322 aa  490  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  96.65 
 
 
322 aa  490  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03989  IS1112 transposase  95.54 
 
 
322 aa  484  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  96.28 
 
 
322 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03519  IS1112 transposase  94.42 
 
 
322 aa  484  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02992  IS1112 transposase  93.68 
 
 
322 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00109  transposase  91.49 
 
 
324 aa  475  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04691  IS1112 transposase  93.68 
 
 
322 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04709  IS1112 transposase  93.68 
 
 
322 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04791  IS1112 transposase  94.42 
 
 
322 aa  475  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.030193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03216  IS1112 transposase  94.42 
 
 
322 aa  474  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01635  IS1112 transposase  93.68 
 
 
322 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.085128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  93.68 
 
 
322 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01527  IS1112 transposase  93.68 
 
 
322 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04853  IS1112 transposase  92.19 
 
 
322 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0362678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00579  transposase  94.87 
 
 
299 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00575  transposase  94.42 
 
 
197 aa  333  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05593  IS1112 transposase  95 
 
 
260 aa  332  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01240  transposase  91.1 
 
 
249 aa  318  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.839107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03303  transposase  99.32 
 
 
276 aa  309  4e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04491  transposase  95.78 
 
 
219 aa  294  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01253  transposase  92.97 
 
 
159 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02914  transposase  93.29 
 
 
159 aa  236  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00677  IS1112 transposase  91.41 
 
 
267 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16701  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00374  transposase  97.3 
 
 
164 aa  232  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  43.23 
 
 
317 aa  206  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  40.52 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03302  transposase, IS30 family  93.52 
 
 
108 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  39.41 
 
 
313 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  39.03 
 
 
335 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  39.03 
 
 
335 aa  193  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  39.03 
 
 
335 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  39.03 
 
 
335 aa  193  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  39.41 
 
 
313 aa  193  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  39.41 
 
 
313 aa  193  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  39.03 
 
 
335 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  39.41 
 
 
313 aa  192  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  39.41 
 
 
313 aa  192  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  39.41 
 
 
313 aa  192  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  39.41 
 
 
313 aa  192  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  39.41 
 
 
313 aa  192  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  39.03 
 
 
315 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  39.03 
 
 
315 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  39.03 
 
 
315 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  39.03 
 
 
315 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  39.03 
 
 
313 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3746  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  38.29 
 
 
313 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0783  integrase catalytic subunit  38.29 
 
 
313 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1506  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4284  integrase catalytic subunit  42.52 
 
 
273 aa  172  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  37.97 
 
 
290 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  37.97 
 
 
290 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4403  integrase catalytic region  37.97 
 
 
290 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.291607  normal  0.47214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2645  integrase catalytic subunit  42.13 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1249  integrase, catalytic region  37.4 
 
 
246 aa  149  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0925898  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0259  transposase  33.46 
 
 
318 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1723  transposase  33.46 
 
 
318 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  37.1 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1466  transposase  33.46 
 
 
318 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163454  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0164  transposase  33.46 
 
 
318 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1082  transposase  33.46 
 
 
318 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0454  transposase  33.46 
 
 
318 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0519  transposase  33.46 
 
 
318 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1637  transposase  33.46 
 
 
318 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1090  transposase  33.46 
 
 
288 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02862  transposase  89.61 
 
 
104 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  34.57 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  35.88 
 
 
423 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  35.88 
 
 
423 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  35.88 
 
 
423 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  35.88 
 
 
423 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  35.88 
 
 
423 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  37.1 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  36.65 
 
 
386 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  35.97 
 
 
336 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0246651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>