More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2359 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2359  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 332 aa  684    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.747939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  37.38 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4598  integrase catalytic region  40.98 
 
 		 336 aa  189  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.658664  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0968  transposase  34.14 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0221  transposase  34.14 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1808  transposase  34.14 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0319  transposase  34.14 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2165  transposase  34.14 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5446  integrase catalytic region  38.23 
 
 		 343 aa  179  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13211  transposase  36.8 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.562916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  36.72 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0141  integrase catalytic subunit  34.53 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  37.06 
 
 		 386 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  36.97 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4602  Integrase catalytic region  36.06 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.792581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3555  Integrase catalytic region  37.25 
 
 		 317 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1287  integrase catalytic region  36.97 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6420  integrase catalytic region  36.97 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4885  integrase catalytic region  36.97 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  37.05 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  37.05 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  37.05 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  37.05 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  37.05 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  34.38 
 
 		 356 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  34.38 
 
 		 356 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  36.42 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  36.42 
 
 		 385 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  36.59 
 
 		 386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  36.39 
 
 		 342 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  35.88 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  35.88 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  33.96 
 
 		 380 aa  158  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  34.16 
 
 		 401 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  36.04 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  34.95 
 
 		 401 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  33.23 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  35.47 
 
 		 386 aa  155  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  36.53 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  36.06 
 
 		 343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  29.25 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  29.25 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 380 aa  152  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  35.08 
 
 		 385 aa  152  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  34.94 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  33.53 
 
 		 457 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  33.53 
 
 		 457 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  33.53 
 
 		 457 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  33.53 
 
 		 457 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  33.53 
 
 		 457 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  33.53 
 
 		 457 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  33.53 
 
 		 457 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  33.53 
 
 		 457 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  33.53 
 
 		 457 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  32.32 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  32.32 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  34.93 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  35.08 
 
 		 385 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  29.25 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  34.12 
 
 		 399 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  34.12 
 
 		 399 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  33.43 
 
 		 457 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  28.93 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  32.83 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7566  transposase  40.59 
 
 		 243 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  34.76 
 
 		 383 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  33.73 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  33.73 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_62  putative integrase  31.46 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559018  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  33.73 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  34.76 
 
 		 383 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  34.76 
 
 		 383 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  34.76 
 
 		 383 aa  149  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  34.76 
 
 		 383 aa  149  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  34.76 
 
 		 383 aa  149  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  34.76 
 
 		 383 aa  149  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  33.95 
 
 		 386 aa  149  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0454  transposase  31.27 
 
 		 318 aa  149  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0164  transposase  31.27 
 
 		 318 aa  149  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1723  transposase  31.27 
 
 		 318 aa  149  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1466  transposase  31.27 
 
 		 318 aa  149  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163454  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1082  transposase  31.27 
 
 		 318 aa  149  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0519  transposase  31.27 
 
 		 318 aa  149  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1637  transposase  31.27 
 
 		 318 aa  149  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0259  transposase  31.27 
 
 		 318 aa  149  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 525 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  32.62 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  32.62 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  32.62 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 519 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  35.47 
 
 		 496 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 519 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 519 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  31.94 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  34.73 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  34.73 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>