More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3589 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  98.72 
 
 		 313 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  99.04 
 
 		 313 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  99.36 
 
 		 313 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  99.04 
 
 		 313 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 313 aa  655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  99.04 
 
 		 313 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  99.04 
 
 		 313 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 313 aa  655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  76.68 
 
 		 313 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  76.68 
 
 		 313 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3746  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0783  integrase catalytic subunit  76.68 
 
 		 313 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  77 
 
 		 313 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2645  integrase catalytic subunit  80.48 
 
 		 251 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4284  integrase catalytic subunit  75.39 
 
 		 273 aa  418  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  54.49 
 
 		 315 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  54.49 
 
 		 315 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  54.49 
 
 		 315 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  54.17 
 
 		 315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  53.7 
 
 		 315 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  44.34 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  44.34 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  44.34 
 
 		 335 aa  245  8e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  44.34 
 
 		 335 aa  245  8e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  44.34 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03519  IS1112 transposase  39.74 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  39.74 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  39.74 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  39.74 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  39.74 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  39.74 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  39.74 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02992  IS1112 transposase  39.42 
 
 		 322 aa  225  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  39.42 
 
 		 322 aa  225  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04709  IS1112 transposase  39.42 
 
 		 322 aa  225  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04691  IS1112 transposase  39.42 
 
 		 322 aa  225  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01527  IS1112 transposase  39.42 
 
 		 322 aa  225  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01635  IS1112 transposase  39.42 
 
 		 322 aa  225  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.085128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04853  IS1112 transposase  39.42 
 
 		 322 aa  222  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0362678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03884  IS1112 transposase  39.1 
 
 		 322 aa  222  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03989  IS1112 transposase  39.1 
 
 		 322 aa  221  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  44.36 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4403  integrase catalytic region  44.36 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.291607  normal  0.47214 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  44.36 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03216  IS1112 transposase  38.14 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04791  IS1112 transposase  38.14 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.030193  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  40.75 
 
 		 317 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00803  IS1112 transposase  38.46 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0987141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00579  transposase  39.71 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00109  transposase  37.54 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04491  transposase  42.31 
 
 		 219 aa  182  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0164  transposase  37.34 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1466  transposase  37.34 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163454  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0259  transposase  37.34 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1637  transposase  37.34 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1723  transposase  37.34 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0519  transposase  37.34 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0454  transposase  37.34 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1082  transposase  37.34 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01240  transposase  40.44 
 
 		 249 aa  179  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.839107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02275  transposase  38.29 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1090  transposase  37.82 
 
 		 288 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  35.74 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_62  putative integrase  33.97 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559018  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  36.02 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00374  transposase  44.81 
 
 		 164 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  34.27 
 
 		 380 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  32.72 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  32.72 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  32.72 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  32.72 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  32.72 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  32.72 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  32.72 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  32.72 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  32.72 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  32.72 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  33.74 
 
 		 380 aa  149  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  33.65 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  35.38 
 
 		 386 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3208  integrase catalytic subunit  33.43 
 
 		 356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>