More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3640 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3640  integrase  100 
 
 		 343 aa  712    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  67.27 
 
 		 342 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  67.27 
 
 		 342 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  67.27 
 
 		 342 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  67.27 
 
 		 342 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  67.27 
 
 		 342 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  67.27 
 
 		 342 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  67.27 
 
 		 342 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  67.27 
 
 		 342 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  67.27 
 
 		 342 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  57.93 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  57.93 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  57.93 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  56.57 
 
 		 326 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  56.57 
 
 		 326 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  56.57 
 
 		 326 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  56.57 
 
 		 326 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  56.06 
 
 		 342 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  52.85 
 
 		 340 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  56.36 
 
 		 342 aa  350  3e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  54.8 
 
 		 342 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  52.77 
 
 		 356 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  52.77 
 
 		 356 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  50.76 
 
 		 339 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  47.58 
 
 		 385 aa  304  1.0000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  47.27 
 
 		 385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  47.24 
 
 		 326 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  48.06 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  49.23 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  49.23 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  49.23 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  49.23 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  49.23 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  47.79 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03433  ISXoo15 transposase  47.94 
 
 		 315 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  48.59 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  43.78 
 
 		 466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  46.27 
 
 		 457 aa  272  6e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  46.27 
 
 		 457 aa  272  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  46.27 
 
 		 457 aa  272  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  46.27 
 
 		 457 aa  272  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  46.27 
 
 		 457 aa  272  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  46.27 
 
 		 457 aa  272  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  46.27 
 
 		 457 aa  272  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  46.27 
 
 		 457 aa  272  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  46.27 
 
 		 457 aa  272  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  46.27 
 
 		 457 aa  272  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  43.59 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  43.59 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  43.59 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  43.59 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  43.59 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  43.59 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  43.59 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  43.59 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  43.59 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  43.59 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  43.59 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  43.59 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  43.59 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  45.94 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  46.25 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  46.18 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  42.28 
 
 		 402 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  46.37 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  43.98 
 
 		 481 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  46.23 
 
 		 496 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  46.23 
 
 		 519 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  46.23 
 
 		 519 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  46.23 
 
 		 519 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  45.45 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  46.23 
 
 		 525 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  46.23 
 
 		 519 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  46.23 
 
 		 519 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  44.79 
 
 		 342 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  45.74 
 
 		 385 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  46.89 
 
 		 386 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  46.89 
 
 		 386 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  45.74 
 
 		 385 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  47.83 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  44.79 
 
 		 386 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  47.49 
 
 		 334 aa  255  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  47.49 
 
 		 334 aa  255  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  39.85 
 
 		 480 aa  254  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  39.85 
 
 		 480 aa  254  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  46.39 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  46.39 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  39.38 
 
 		 437 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  39.38 
 
 		 437 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  39.38 
 
 		 437 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  39.38 
 
 		 437 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  39.38 
 
 		 474 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  39.38 
 
 		 474 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  39.38 
 
 		 474 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  44.65 
 
 		 386 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  39.38 
 
 		 414 aa  248  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  43.87 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  43.64 
 
 		 383 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  45.97 
 
 		 370 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>