More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2850 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  100 
 
 
315 aa  653    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  100 
 
 
315 aa  653    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  99.68 
 
 
315 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  100 
 
 
315 aa  653    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  94.92 
 
 
315 aa  620  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  54.81 
 
 
313 aa  342  4e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  54.81 
 
 
313 aa  342  5e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  54.81 
 
 
313 aa  342  5e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  54.81 
 
 
313 aa  342  5e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  54.81 
 
 
313 aa  342  5e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  54.49 
 
 
313 aa  340  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  54.49 
 
 
313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  54.49 
 
 
313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3746  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  52.73 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  52.41 
 
 
313 aa  328  7e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0783  integrase catalytic subunit  52.41 
 
 
313 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  52.41 
 
 
313 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4284  integrase catalytic subunit  54.28 
 
 
273 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2645  integrase catalytic subunit  57.14 
 
 
251 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  43.85 
 
 
335 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  43.85 
 
 
335 aa  259  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  43.85 
 
 
335 aa  259  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  43.85 
 
 
335 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  43.53 
 
 
335 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  42.14 
 
 
290 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4403  integrase catalytic region  42.14 
 
 
290 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.291607  normal  0.47214 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  42.14 
 
 
290 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  43.45 
 
 
317 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  40.06 
 
 
322 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  40.06 
 
 
322 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  40.06 
 
 
322 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  40.06 
 
 
322 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  40.06 
 
 
322 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  40.06 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03519  IS1112 transposase  39.42 
 
 
322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03884  IS1112 transposase  39.42 
 
 
322 aa  218  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01635  IS1112 transposase  38.78 
 
 
322 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.085128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  38.78 
 
 
322 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04691  IS1112 transposase  38.78 
 
 
322 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01527  IS1112 transposase  38.78 
 
 
322 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02992  IS1112 transposase  38.78 
 
 
322 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04709  IS1112 transposase  38.78 
 
 
322 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1637  transposase  39.35 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0164  transposase  39.35 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0259  transposase  39.35 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1082  transposase  39.35 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1723  transposase  39.35 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0519  transposase  39.35 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0454  transposase  39.35 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1466  transposase  39.35 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03989  IS1112 transposase  38.78 
 
 
322 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00803  IS1112 transposase  38.78 
 
 
322 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0987141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04853  IS1112 transposase  38.78 
 
 
322 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0362678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03216  IS1112 transposase  37.82 
 
 
322 aa  203  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04791  IS1112 transposase  37.82 
 
 
322 aa  203  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.030193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00579  transposase  40.14 
 
 
299 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1090  transposase  38.49 
 
 
288 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  37.85 
 
 
339 aa  189  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  37.85 
 
 
339 aa  189  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  37.85 
 
 
339 aa  189  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  39.17 
 
 
385 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1808  transposase  36.68 
 
 
330 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0221  transposase  36.68 
 
 
330 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0968  transposase  36.68 
 
 
330 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0319  transposase  36.68 
 
 
330 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2165  transposase  36.68 
 
 
330 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  39.17 
 
 
385 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00109  transposase  37.98 
 
 
324 aa  186  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  37.78 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  37.78 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  37.78 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  37.78 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_62  putative integrase  35.6 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  35.89 
 
 
342 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  35.89 
 
 
342 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  35.89 
 
 
342 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  35.89 
 
 
342 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  35.89 
 
 
342 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  35.89 
 
 
342 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  35.89 
 
 
342 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  35.89 
 
 
342 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>