More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03989 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03989  IS1112 transposase  100 
 
 
322 aa  659    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03519  IS1112 transposase  96.89 
 
 
322 aa  600  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03884  IS1112 transposase  97.2 
 
 
322 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04791  IS1112 transposase  96.58 
 
 
322 aa  597  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.030193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03216  IS1112 transposase  96.89 
 
 
322 aa  600  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  96.89 
 
 
322 aa  600  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  96.58 
 
 
322 aa  596  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  96.58 
 
 
322 aa  596  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  96.58 
 
 
322 aa  596  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  96.58 
 
 
322 aa  596  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  96.58 
 
 
322 aa  596  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00803  IS1112 transposase  95.34 
 
 
322 aa  592  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0987141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04691  IS1112 transposase  94.72 
 
 
322 aa  585  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04709  IS1112 transposase  94.72 
 
 
322 aa  585  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  94.72 
 
 
322 aa  585  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01635  IS1112 transposase  94.72 
 
 
322 aa  585  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.085128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01527  IS1112 transposase  94.72 
 
 
322 aa  585  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02992  IS1112 transposase  94.72 
 
 
322 aa  585  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04853  IS1112 transposase  94.1 
 
 
322 aa  581  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0362678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00109  transposase  96.95 
 
 
324 aa  541  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00579  transposase  96.52 
 
 
299 aa  527  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02275  transposase  95.54 
 
 
289 aa  483  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04491  transposase  98.63 
 
 
219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01240  transposase  95.67 
 
 
249 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.839107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05593  IS1112 transposase  95 
 
 
260 aa  335  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00575  transposase  94.42 
 
 
197 aa  332  5e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00374  transposase  95.12 
 
 
164 aa  330  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03303  transposase  85.34 
 
 
276 aa  293  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01253  transposase  97.97 
 
 
159 aa  286  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00677  IS1112 transposase  96.88 
 
 
267 aa  248  8e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16701  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  43.41 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02914  transposase  93.96 
 
 
159 aa  241  9e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 
315 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  40.06 
 
 
313 aa  236  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  40.06 
 
 
313 aa  236  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  40.06 
 
 
313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  40.06 
 
 
313 aa  235  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  40.06 
 
 
313 aa  235  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  40.06 
 
 
313 aa  235  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  40.06 
 
 
313 aa  235  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  39.74 
 
 
313 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  39.74 
 
 
315 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  39.74 
 
 
315 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  39.74 
 
 
315 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  39.74 
 
 
315 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  38.14 
 
 
335 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  38.14 
 
 
335 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  38.14 
 
 
335 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  39.68 
 
 
313 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  38.14 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3746  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  37.82 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4284  integrase catalytic subunit  43.18 
 
 
273 aa  220  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  39.03 
 
 
313 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0783  integrase catalytic subunit  39.03 
 
 
313 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03302  transposase, IS30 family  99.07 
 
 
108 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  36.93 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  36.93 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4403  integrase catalytic region  36.93 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.291607  normal  0.47214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2645  integrase catalytic subunit  41.18 
 
 
251 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  35 
 
 
316 aa  169  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  35.63 
 
 
336 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  37.61 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  37.61 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  37.61 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  37.61 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  37.61 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  37.54 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  35.47 
 
 
380 aa  163  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  38.02 
 
 
342 aa  162  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  36.56 
 
 
385 aa  162  9e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  35.17 
 
 
380 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  36.56 
 
 
385 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  36.62 
 
 
386 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1466  transposase  32.04 
 
 
318 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163454  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1723  transposase  32.04 
 
 
318 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0164  transposase  32.04 
 
 
318 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1637  transposase  32.04 
 
 
318 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1082  transposase  32.04 
 
 
318 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0259  transposase  32.04 
 
 
318 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0519  transposase  32.04 
 
 
318 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>