More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0527 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0527  ROK family protein  100 
 
 
371 aa  762    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0541  ROK family protein  98.92 
 
 
371 aa  756    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0625094  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0452  ROK family protein  29.81 
 
 
368 aa  149  8e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00127145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1822  ROK family protein  28.47 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.720811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.25 
 
 
408 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  25.41 
 
 
402 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  26.04 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  25.44 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.76 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  24.86 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  27.6 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.65 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  24.36 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  28.1 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  24.07 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  23.62 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  27.66 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  22.69 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  24.72 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  26.14 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  22.89 
 
 
442 aa  79.3  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  26.69 
 
 
396 aa  79.3  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  22.99 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  26.48 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0118  ROK family protein  29.17 
 
 
350 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  26.52 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  25.45 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  22.25 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2190  ROK family protein  25.95 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  23.46 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  27.55 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.36 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  25.41 
 
 
435 aa  73.2  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  26.03 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0120  ROK family protein  27.98 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  24.7 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  26.32 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  22.08 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  25.62 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  27.3 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  27.67 
 
 
390 aa  69.3  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  23.23 
 
 
425 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.04 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  24.36 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  26.91 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  24.04 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  25.51 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  23.93 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.69 
 
 
503 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  24.7 
 
 
388 aa  67  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  24.18 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  23.08 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  26.6 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.37 
 
 
410 aa  66.2  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  23.82 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  28.76 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.74 
 
 
414 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  26.59 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  26.67 
 
 
381 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  25.38 
 
 
393 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  26.35 
 
 
405 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  27.44 
 
 
387 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  25.86 
 
 
406 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  25 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  23.69 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  25 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  25 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  25 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  25 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  25 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  25 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  25 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  25 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  22.78 
 
 
386 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  22.71 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  27.48 
 
 
401 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  24.26 
 
 
400 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  27.14 
 
 
364 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  23.14 
 
 
414 aa  63.9  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.95 
 
 
400 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1214  transcriptional regulator  22.52 
 
 
400 aa  63.5  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  24.91 
 
 
385 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  24.71 
 
 
417 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  23.79 
 
 
404 aa  63.2  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  25 
 
 
393 aa  63.2  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  24.79 
 
 
397 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  23.3 
 
 
406 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  26.79 
 
 
402 aa  63.2  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  24.03 
 
 
389 aa  62.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0208  NagC family transcriptional regulator  22.1 
 
 
374 aa  62  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  24.81 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  21.89 
 
 
404 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  26.01 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  23.1 
 
 
404 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2815  ROK family protein  25.37 
 
 
389 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231049  normal  0.37172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  24.9 
 
 
402 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  26.71 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  26.89 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  23.57 
 
 
401 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  20.94 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>