More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1715 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1715  ROK family protein  100 
 
 		 425 aa  828    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.853629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  35.21 
 
 		 407 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  34.36 
 
 		 379 aa  139  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  32.95 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.78 
 
 		 383 aa  119  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  27.88 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  33.15 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  29.75 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  31.48 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.65 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  25.38 
 
 		 364 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  30.56 
 
 		 384 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  31.68 
 
 		 397 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  32.84 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.58 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  30.45 
 
 		 387 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  31.53 
 
 		 429 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.26 
 
 		 385 aa  106  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  24.37 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  29.78 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  32.56 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  31.17 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  28.1 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  24.6 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  32.54 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  30.99 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30.99 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  30.37 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  32.18 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  28.19 
 
 		 425 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  32.52 
 
 		 403 aa  103  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  27.3 
 
 		 410 aa  103  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  29.57 
 
 		 390 aa  103  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  27.54 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  29.2 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  29.12 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  31.46 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  27.22 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  29.26 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  31.02 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05680  transcriptional regulator/sugar kinase  30.67 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.244625  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  32.2 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  27.38 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  28.28 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  30.7 
 
 		 395 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  29.01 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  30.67 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  32.34 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4664  ROK family protein  29.54 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213413  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  29.95 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  22.95 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  30.14 
 
 		 404 aa  97.1  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  31.75 
 
 		 397 aa  96.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.22 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  30.35 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  29.18 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  29.53 
 
 		 401 aa  95.5  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  24.36 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  26.4 
 
 		 428 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.28 
 
 		 503 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  30.37 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  30.77 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  30.03 
 
 		 401 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  27.05 
 
 		 320 aa  93.6  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  30.29 
 
 		 395 aa  94  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  19.87 
 
 		 372 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  27.35 
 
 		 393 aa  93.6  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  27.13 
 
 		 381 aa  93.2  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  30.06 
 
 		 392 aa  93.6  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  27.75 
 
 		 425 aa  93.2  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  27.76 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  27.9 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  31.23 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  30.11 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  26.86 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  29.31 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  26.52 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  27.47 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0206  NagC family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.520067  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  25.22 
 
 		 372 aa  91.3  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  31.12 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  28.12 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  26.14 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  25.85 
 
 		 410 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  25.54 
 
 		 393 aa  90.1  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  27.72 
 
 		 347 aa  90.1  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.14 
 
 		 396 aa  89.7  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  30.51 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1730  transcriptional repressor of the xylose operon  28.14 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332399  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  21.43 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  25.85 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  28.44 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  26.81 
 
 		 443 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  29.34 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  29.04 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  24.32 
 
 		 388 aa  89  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  29.21 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  24.56 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  25.69 
 
 		 409 aa  87.8  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  31.42 
 
 		 390 aa  88.2  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>