121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2141 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
174 aa  354  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  65.33 
 
 
179 aa  203  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  65.33 
 
 
237 aa  202  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  62.11 
 
 
173 aa  202  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  66.2 
 
 
160 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  67.63 
 
 
163 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  66.91 
 
 
163 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  63.23 
 
 
184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  67.69 
 
 
226 aa  174  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  56.96 
 
 
172 aa  168  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  61.11 
 
 
169 aa  167  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  57.69 
 
 
191 aa  166  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  58.87 
 
 
183 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  52.51 
 
 
191 aa  166  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  61.15 
 
 
154 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  62.31 
 
 
185 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  59.46 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  61.36 
 
 
186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  58.16 
 
 
169 aa  160  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  59.33 
 
 
181 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  61.54 
 
 
183 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  62.31 
 
 
185 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  59.23 
 
 
182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  51.33 
 
 
179 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  49.64 
 
 
168 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  54.26 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
170 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
169 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 
169 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
172 aa  120  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
169 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  60.22 
 
 
172 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
146 aa  101  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 
158 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  45.22 
 
 
157 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
167 aa  97.4  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
152 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
167 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
160 aa  94  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 
160 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
158 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 
160 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
160 aa  90.9  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
160 aa  90.9  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
160 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
160 aa  90.9  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 
160 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  37.84 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
160 aa  90.5  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  38.74 
 
 
148 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 
183 aa  87.4  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  46.39 
 
 
187 aa  84  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  34.48 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0119  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
154 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 
151 aa  47.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
159 aa  47.8  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
162 aa  47.4  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
147 aa  47.4  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  25.49 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
174 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
326 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
144 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
336 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
161 aa  45.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
148 aa  45.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  30.16 
 
 
139 aa  44.7  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
159 aa  44.7  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
158 aa  44.7  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
153 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
165 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
146 aa  44.3  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
139 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2391  transcriptional regulator, MarR family protein  27.61 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.515688  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  22.96 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  23.66 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
181 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>