86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4905 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  46.07 
 
 		 186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  44.38 
 
 		 186 aa  160  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4209  MarR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0466209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  39.77 
 
 		 187 aa  120  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 163 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2233  transcriptional regulatory protein  33.04 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  29 
 
 		 171 aa  47.8  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1520  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 158 aa  47.8  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.854006  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  25.86 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  26.43 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  29.76 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 147 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  23.4 
 
 		 197 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 141 aa  44.7  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0521  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 150 aa  44.7  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  29 
 
 		 162 aa  44.7  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1405  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.159583  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  28.71 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0509  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  28 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  27.72 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  27.72 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 315 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  26.04 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  27.72 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  27.72 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  27.72 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  27.72 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  27.72 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3848  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 325 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.0322518 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 178 aa  42  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  25.36 
 
 		 174 aa  42  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 159 aa  42  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 149 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 134 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  42  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1316  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 153 aa  41.6  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.061965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  31.13 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  27.72 
 
 		 176 aa  42  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 141 aa  41.2  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 171 aa  41.2  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 314 aa  41.2  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 162 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 198 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 162 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  25.66 
 
 		 176 aa  41.2  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 144 aa  41.2  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 166 aa  41.2  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 165 aa  40.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 145 aa  40.8  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 206 aa  40.8  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 157 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  21.11 
 
 		 207 aa  40.8  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>