180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3423 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  298  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  35.71 
 
 		 158 aa  62  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2794  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6072  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2770  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2661  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0174  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.63734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0832  MarR family regulatory protein  34.23 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2774  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2305  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0654  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536381  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0670  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2385  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0363  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0555  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0542  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  27.48 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  32 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0638  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1138  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.518739  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4061  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 299 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  26.88 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  27.74 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  22.69 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  44.9 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  31.52 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  29.17 
 
 		 283 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  24.03 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  34.18 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  38.98 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 174 aa  43.9  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 172 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  47.83 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  42.86 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  25.98 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1424  transcriptional regulator  19.3 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0154765  hitchhiker  0.000999749 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>