More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0542 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I0542  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  293  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0654  MarR family transcriptional regulator  96.53 
 
 		 144 aa  286  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2305  MarR family transcriptional regulator  96.53 
 
 		 144 aa  286  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0174  MarR family transcriptional regulator  96.53 
 
 		 144 aa  286  7e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.63734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0832  MarR family regulatory protein  96.53 
 
 		 144 aa  286  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2385  MarR family transcriptional regulator  96.53 
 
 		 144 aa  286  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0670  MarR family transcriptional regulator  96.53 
 
 		 144 aa  286  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2774  MarR family transcriptional regulator  96.53 
 
 		 144 aa  286  7e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0555  MarR family transcriptional regulator  81.12 
 
 		 148 aa  246  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2770  MarR family transcriptional regulator  79.72 
 
 		 148 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6072  MarR family transcriptional regulator  79.72 
 
 		 148 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  78.32 
 
 		 148 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  78.32 
 
 		 148 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2661  MarR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 148 aa  236  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0638  transcriptional regulator, MarR family  79.43 
 
 		 169 aa  234  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16424 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2794  MarR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 157 aa  234  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4061  MarR family transcriptional regulator  78.01 
 
 		 170 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0363  MarR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 156 aa  221  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  62.59 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  62.14 
 
 		 165 aa  184  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  62.14 
 
 		 165 aa  184  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  50.7 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  37.6 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  26.79 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 158 aa  52  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  45.21 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  35.58 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 164 aa  50.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  44.78 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  37.21 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  39.74 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.07 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.07 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.07 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.07 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.07 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5154  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07865e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4754  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5190  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0088303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4773  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5185  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  29.92 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 186 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  30.16 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>