More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01785 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  100 
 
 		 158 aa  322  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  89.58 
 
 		 165 aa  273  7e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  89.58 
 
 		 165 aa  273  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0174  MarR family transcriptional regulator  63.57 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.63734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0832  MarR family regulatory protein  63.57 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2305  MarR family transcriptional regulator  63.57 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2385  MarR family transcriptional regulator  63.57 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0670  MarR family transcriptional regulator  63.57 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0654  MarR family transcriptional regulator  63.57 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536381  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2774  MarR family transcriptional regulator  63.57 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0542  MarR family transcriptional regulator  62.59 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  63.31 
 
 		 148 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  63.31 
 
 		 148 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2770  MarR family transcriptional regulator  63.31 
 
 		 148 aa  184  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0555  MarR family transcriptional regulator  63.31 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2794  MarR family transcriptional regulator  63.31 
 
 		 157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6072  MarR family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4061  MarR family transcriptional regulator  62.59 
 
 		 170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0638  transcriptional regulator, MarR family  63.31 
 
 		 169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16424 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2661  MarR family transcriptional regulator  62.59 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0363  MarR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  53.15 
 
 		 153 aa  156  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 195 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0540  transcriptional regulator, MarR family  23.97 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  26.61 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  28.36 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0501  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0087  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.383416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3280  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  0.011902 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.61 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  37.21 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>